1.首先是医用一体化污水处理设备消毒处理（一级处理）：部分医院综合污水处理可采用一些凝结沉淀方法，采用预处理，去除污水携带的病毒和细菌颗粒，然后一级加强消毒处理，不仅可以减少消毒剂的用量，而且有效提高消毒效果，避免过度使用消毒剂，对周围环境造成污染。医院污水处理系统前部将设置自动格栅，医院污水进入调节池，调节池污水提高沉淀，沉淀水进入接触池再次消毒，使接触池排放的水直接达到排放标准。污水处理消毒系统的污泥和栅栏将集中消毒污水处理站产生的污水垃圾，然后运输。此外，消毒处理不仅可以去除污水中携带病毒和细菌的颗粒物，还可以达到良好的消毒效果，增加后续消毒剂的用量，降低投资成本，有利于二次处理。

2.医用一体化污水处理设备物理处理（二次处理）：主要去除污水中90%以上的有机污染物，去除悬浮物95%以上，使污水中的有机物达到排放标准。二次处理的过程是将综合污水放入调节池，然后进行生物氧化和最终接触消毒。由于调节池内设有升降泵，一般生活污水通过化粪池直接到达调节池，污水通过调节池直接进行生物处理。这样，污水就可以进入接触池进行消毒和进一步排放。对于调节池、生化池、接触池产生的垃圾和污泥，需要用石灰石集中消毒，然后送出焚烧，二次处理工艺多为非传染病医院或传染病医院分别收集的污水和粪便。部分粪便应提前独立消毒，可通过下水道单独处理或直接进入化粪池。生活污水处理后的二次处理工艺大部分为非传染病医院或传染病医院的污水和粪便。所有工艺均在封闭环境中运行，经统一通风处理后进行通风。最后，废弃消毒在排放前采用紫外线消毒。二次处理可降低部分垃圾物体的浓度。其特点是采用有氧处理工艺，具有过滤功能，更有利于消毒，更适合排入自然水体的污水处理。